离子色谱耗材不受样品挥发性的限制，流动相可选择的范围宽，固定相的种类繁多，因而可以分离热不稳定和非挥发性的、离解的和非离解的以及各种分子量范围的物质。与试样预处理技术相配合，所达到的高分辨率和高灵敏度，使分离和同时测定性质上十分相近的物质成为可能，能够分离复杂相体中的微量成分。随着固定相的发展，更换流动相pH后柱再平衡速度快，改善的批次之间重现性，有可能在充分保持生化物质活性的条件下完成其分离成为解决生化分析问题有前途的方法。